Theo cáo trạng, năm 2020, Sở GD&ĐT tỉnh Thanh Hóa triển khai thực hiện 2 gói thầu mua đồ dùng dạy học lớp 1 thực hiện chương trình sách giáo khoa mới từ năm 2020-2021 cho các trường trên địa bàn tỉnh, tổng giá trị hơn 119 tỷ đồng.
Do muốn trúng 2 gói thầu trên, Giám đốc Công ty Sách Thanh Hóa Lê Thế Sơn (SN 1971) đã đến gặp bà Phạm Thị Hằng - Giám đốc Sở GD&ĐT Thanh Hóa xin tham gia, tạo điều kiện.
Sau đó, bà Hằng đã chỉ đạo Lê Văn Cương (SN 1960, Trưởng phòng Kế hoạch - Tài chính), Nguyễn Văn Phụng (SN 1971, Chuyên viên phòng Kế hoạch, tài chính) tạo điều kiện cho Công ty Sách Thanh Hóa của Sơn tham gia, trúng thầu.
Quá trình thực hiện gói thầu số 1, bị can Cương và Phụng đã thống nhất với Sơn để liên danh Thanh Hà (Công ty Sách Thanh Hóa và Công ty Hoàng Đạo) trúng thầu gói thầu số 1.
Để hợp thức hóa hồ sơ, đủ điều kiện trúng thầu, Cương, Phụng và Sơn đã thống nhất lập danh mục thiết bị, giá từng loại thiết bị dạy học lớp 1.
Sau đó, Sơn liên hệ với Bùi Việt Long (SN 1981, Phó Trưởng phòng kinh doanh Công ty Hoàng Đạo) lấy thông số kỹ thuật, cấu hình, giá máy chiếu… rồi tự thống nhất giá để bà Hằng ký tờ trình xin UBND tỉnh phê duyệt chủ trương thực hiện gói thầu.
Khi được chấp thuận chủ trương, bà Hằng đã ký hợp đồng thuê Công ty thẩm định giá BTC VALUE thẩm định giá thiết bị gói thầu số 1 do Hồ Thị Sáu (SN 1989) đại diện. Sáu đã sử dụng danh mục, giá thiết bị đã được Phụng, Sơn thống nhất từ trước rồi sửa dự thảo chứng thư thẩm định giá theo yêu cầu của hai người này.
Từ danh mục đã được thống nhất, UBND tỉnh Thanh Hóa đã phê duyệt dự toán mua đồ dùng dạy học gói thầu số 1 với tổng dự toán kinh phí trên 33,6 tỷ đồng.
Sau khi đã được UBND tỉnh phê duyệt dự toán, bà Hằng chỉ định Công ty Nam Anh lập hồ sơ mời thầu và đánh giá hồ sơ dự thầu mà không thẩm định hồ sơ năng lực của công ty này theo đúng quy định. Bản thân Nguyễn Duy Linh là giám đốc công ty Nam Anh không có chứng chỉ hành nghề hoạt động đấu thầu, nhưng Linh đã giả mạo hồ sơ, đưa bằng cấp của người khác vào cho đủ điều kiện.
Linh đã soạn thảo biên bản thương thảo hợp đồng, hợp đồng tư vấn, quyết định chỉ định thầu gửi cho Bùi Trí Thức (SN 1984, chuyên viên Phòng Kế hoạch - Tài chính, Sở GD&ĐT Thanh Hóa) để Thức “hợp thức hóa” trình bà Hằng ký phê duyệt để lập hồ sơ mời thầu.
Tương tự, tại gói thầu số 2, ngoài các đối tượng trên còn có Trịnh Hữu Nghĩa (SN 1969, Phó Trưởng phòng Kế hoạch - Tài chính, thay cho Lê Văn Cương đã nghỉ hưu), Vũ Thị Ninh (SN 1973, Kế toán trưởng Công ty CP sách và Thiết bị trường học Thanh Hóa), Đặng Xuân Minh (SN 1977, Chủ tịch HĐQT kiêm TGĐ Công ty BTC VALUE, Nguyễn Quốc Việt (SN 1977, Thẩm định viên của Công ty BTC VALUE) đã thỏa thuận, thông đồng, lập khống hồ sơ, giấy tờ để hợp thức hóa, trình các cơ quan liên quan thông qua.
Ở gói thầu số 2 có giá trị gần 87 tỷ đồng, Công ty Sách Thanh Hóa không đủ năng lực để tham gia nên Sơn đã chủ động liên hệ với Công ty Hoàng Đạo, Công ty Khang An, Công ty Nam Hoa và Công ty Long Thành đề nghị cùng tham gia liên danh đấu thầu với tên gọi liên danh Thanh Hà - Thanh Hóa.
Do đã thông đồng, sắp xếp từ trước nên các công ty trên đã dễ dàng trúng 2 gói thầu có tổng giá trị 119,6 tỷ đồng.
Cơ quan chức năng xác định, những sai phạm tại 2 gói thầu của Sở GD&ĐT Thanh Hóa đã gây thiệt hại ngân sách nhà nước gần 21 tỷ đồng.
Sau khi kết thúc mỗi gói thầu, Lại Thế Sơn đã đến phòng làm việc đưa cho Nguyễn Văn Phụng 3 tỷ đồng, tổng cộng 2 lần là 6 tỷ đồng.
Sau đó, Phụng phân chia số tiền này cho các cá nhân tại Sở GD&ĐT như sau: bà Phạm Thị Hằng 3 tỷ đồng (Phụng đưa 2,8 tỷ; Sơn đưa 200 triệu), Trịnh Hữu Nghĩa 1,65 tỷ đồng, Lê Văn Cương 250 triệu đồng, Nguyễn Văn Phụng 700 triệu đồng, Bùi Trí Thức 300 triệu đồng. Số tiền 300 triệu còn lại Phụng khai giữ lại cho Phòng Kế hoạch - Tài chính.